Настоящее геологическое изучение Дагестана начинается в 1860 году с исследований академика Абиха, которого называют «отцом кавказской геологии».
В 1894 году на месторождении «Берикей» бывшим железнодорожным служащим В. И. Козляковским была пробурена первая скважина и с глубины 182 метров получена нефть.
В 1936 году ударом 600-тонного фонтана нефти из скважины № 8 на месторождении «Избербаш» было положено начало промышленной добыче нефти в Дагестане.
Неоценим вклад нефтяников Дагестана и в дело Победы в годы Великой Отечественной войны. В суровые сороковые годы многие нефтяники добровольцами ушли на фронт, на их место становились женщины, дети и старики. Вместе с оставшимися нефтяниками они ковали Победу на трудовом фронте. В 1942 году были открыты месторождения «Махачкала» и «Тарнаир», давшие в годы войны немало топлива и горюче смазочного материала для боевых машин.
В 1948 году по предложению инженера Б. А. Рагинского впервые в Советском Союзе было начато строительство морской эстакады для разработки Избербашского нефтяного месторождения.
С 1958 года начинается широкое освоение Ногайской степи. В 1959 году из скважины № 2 в Южно-Сухокумске был получен нефтяной фонтан, с которого началось возрождение и дальнейшее развитие отрасли.
Максимальный уровень добычи нефти в республике был достигнут в 1970 году — 2 млн. 178 тыс. тонн.
С 1971 года начался спад добычи нефти, не точной и превышенной оказалась первоначальная геологическая оценка наличия в недрах Дагестана «черного золота».
В 90-х годах прошлого века в период политической и экономической нестабильности из-за военных действий в Чеченской Республике объединение «Дагнефть» оказалось в тяжелейшем положении. Нефтяники Дагестана практически были брошены на самовыживание.
В мае 1994 года производственное объединение «Дагнефть» было преобразовано в Акционерное общество открытого типа с государственной долей в уставном капитале 51%.
В трагические для Дагестана дни 1999 года, когда отряды бандформирований вторглись в республику нефтяники Дагестана в составе отрядов самообороны в первый же день выехали в Ботлихский район и встали на защиту Родины, территориальной целостности Российской Федерации.
В 2003 году для ведения работ по разведке и разработке нефтяных и газовых месторождений в Приморской зоне Предгорного Дагестана протоколом заседания Совета директоров ОАО «НК „Роснефть“ — Дагнефть» от 21 июля 2003 года № 3 было принято решение о создании ОАО «Дагнефтегаз», где 60% уставного капитала принадлежит ОАО «НК "Роснефть" — Дагнефть», а 40% - ОАО НК «Роснефть».
Инновационная модернизация Общества началась с приходом к руководству Муслима Гиндиева, который был избран генеральным директором компании в 2011 году.
В 2014 году ПАО «НК „Роснефть“ — Дагнефть» заняло 2-е место в интегрированном рейтинге среди нефтегазодобывающих дочерних обществ ОАО «НК Роснефть» группы Б (с добычей нефти до 6 млн. тонн).
В 2015 году ОАО «НК „Роснефть“ — Дагнефть» было преобразовано в Публичное акционерное общество «НК „Роснефть“-Дагнефть».
В 2015 году в интегрированном рейтинге среди нефтегазодобывающих дочерних обществ ОАО НК «Роснефть» группы Б (с добычей нефти до 6 млн. тонн) ПАО «НК «Роснефть» — Дагнефть» вышло на 1-е место.
Осуществлена реконструкция нефтепровода от ГС г. Южно-Сухокумска до ЦППНиГ ООО «РН-Ставропольнефтегаз» протяженностью 51 км. а также реконструированы проблемные участки нефтепроводов общей протяженностью 26,2 км.
В Обществе разработана программа комплексного развития на долгосрочную перспективу.
В 2020 ПАО «НК "Роснефть"-Дагнефть» было преобразовано в АО «НК "Роснефть"-Дагнефть».
В 2021 году АО «НК "Роснефть"-Дагнефть» преобразовано в АО «Дагнефть».